Знамя школы является символом чести школы, верности её традициям.

Знамя школы представляет собой двухстороннее прямоугольное полотнище с чередованием белого, синего и красного цветов, прикреплённое к древку.

В центре полотнища изображена эмблема с надписью «Средняя общеобразовательная школа №2»;

указание города - Судак и раскрытая книга - символ знаний и стремления к ним.

Рядом с книгой - чернильница, символизирующая возможность каждого обучающегося написать новую страницу в истории школы.

Над книгой - солнце, освещающее путь к знаниям.

Цвета знамени отображают представления о школьной жизни:

Красный цвет - доброту, человечность;

Синий цвет - постижение знаний, взросление;

Белый цвет - чистоту, мудрость, святость.